Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Reep3Q99KK1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Reep3Q99KK1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms