Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn2aQ99KJ0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2aQ99KJ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms