Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dok4Q99KE3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dok4Q99KE3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms