Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TirapQ99JY1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TirapQ99JY1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms