Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krcc1Q99JT5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms