Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddb2Q99J79 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddb2Q99J79 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms