Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Slc8b1Q925Q3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Slc8b1Q925Q3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Slc8b1Q925Q3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc8b1Q925Q3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc8b1Q925Q3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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