Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf144aQ925F3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf144aQ925F3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf144aQ925F3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf144aQ925F3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf144aQ925F3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf144aQ925F3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf144aQ925F3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf144aQ925F3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf144aQ925F3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf144aQ925F3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf144aQ925F3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf144aQ925F3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf144aQ925F3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf144aQ925F3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf144aQ925F3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf144aQ925F3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf144aQ925F3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf144aQ925F3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf144aQ925F3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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