Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrif1Q923B3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms