Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Odf3Q920N1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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