Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SncbQ91ZZ3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SncbQ91ZZ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms