Protein–RNA interactions for Protein: Q91W67

Ubl7, Ubiquitin-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl7Q91W67 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ubl7Q91W67 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl7Q91W67 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms