Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms