Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms