Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms