Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stx18Q8VDS8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx18Q8VDS8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx18Q8VDS8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms