Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MpdzQ8VBX6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms