Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R3C1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R3C1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms