Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms