Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp4Q8R2N2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms