Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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H2afjQ8R1M2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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H2afjQ8R1M2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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H2afjQ8R1M2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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H2afjQ8R1M2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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H2afjQ8R1M2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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H2afjQ8R1M2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afjQ8R1M2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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