Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1L4

Kdelr3, ER lumen protein-retaining receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr3Q8R1L4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdelr3Q8R1L4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdelr3Q8R1L4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms