Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms