Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms