Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsl1Q8K305 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms