Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Fbxo18Q8K2I9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Fbxo18Q8K2I9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Fbxo18Q8K2I9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Fbxo18Q8K2I9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Fbxo18Q8K2I9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Fbxo18Q8K2I9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Fbxo18Q8K2I9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Fbxo18Q8K2I9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms