Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms