Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms