Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdc34Q8CFI2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdc34Q8CFI2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdc34Q8CFI2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdc34Q8CFI2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdc34Q8CFI2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdc34Q8CFI2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdc34Q8CFI2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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