Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ercc8Q8CFD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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