Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms