Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms