Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Lrif1Q8CDD9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Lrif1Q8CDD9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Lrif1Q8CDD9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Lrif1Q8CDD9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrif1Q8CDD9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms