Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin52Q8CD94 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms