Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nsun3Q8CCT7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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