Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms