Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrbnQ8C7D2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrbnQ8C7D2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrbnQ8C7D2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrbnQ8C7D2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrbnQ8C7D2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrbnQ8C7D2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms