Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms