Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms