Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Snx16Q8C080 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx16Q8C080 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms