Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn17Q8BXA6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn17Q8BXA6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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