Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms