Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms