Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3s2Q8BSZ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms