Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap4Q8BMK4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms