Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem260Q8BMD6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms