Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LsampQ8BLK3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LsampQ8BLK3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms