Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms