Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra5Q8BHJ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms