Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms